报告题目:基于深度学习的单细胞标注
报告时间:2022年11月24日(周四)下午2:00-3:00
腾讯会议:690-950-4009
报告人:邓明华 北京大学 教授
报告摘要:随着单细胞人类细胞图谱(HCA)等大型研究计划的进行,大量的RNA测序数据得以汇集,这些大型单细胞图谱可以作为目标研究的参考数据。然而,由于数据集之间的批次效应(Batch Effect),使得基于参考数据的学习变得困难。本报告将介绍课题组最近开发的两个算法scSemiCluster和scMRA. 前者考察从单个参考数据、后者考察从多个参考数据到目标数据的标注迁移问题;算法挖掘了不同细胞类型的结构关系,在实现目标数据精确标注的同时,能够有效去除不同数据之间的批次效应。
报告人简介:邓明华,北京大学数学科学学院教授。1987年9月-1998年1月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。现任中国商业统计学会副会长,中国工业与应用数学学会数学建模专业委员会副主任,中国运筹学会计算系统生物学分会理事;邓明华从事生物信息学研究,发表SCI论文90余篇。曾先后主持6项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目和2项科技部重点研发项目。